采用荫棚出芝期管理
在接菌种后经过2个月的培养，菌丝发满整个段木，形成菌棒，在接种口周围及树皮裂缝处可见幼小菌蕾，马上撤垛进入荫棚。荫棚应选择在离水源近、土质疏松、蓄水性好的向阳处。菌棒在荫棚内摆成“人”字形架或篱笆架，棚内湿度保持在90％。遇到阴雨天少喷或不喷水，晴天干燥时要勤喷水，以早晚两次喷水为宜。
采用埋土出芝期管理
先将菌棒平放埋于沙壤土或细沙之中，土壤ｐＨ值为4～6。沙壤土先用水喷湿，保持湿润，棚内的气温保持25℃左右。春天接种的段木，5月埋土，6～7月出芝。秋天接种的段木，埋土后越冬，第二年春天，气温回升到25℃左右，挖出几段检查，若发现接种孔周围有褐色出现，菌棒两端出现褐色菌膜，并能嗅到有灵芝菌丝的气味，表明菌丝生长已成熟。此时要经常洒水，保持土壤表面的湿润。7～10天后，灵芝原基开始形成，要提高棚内空气湿度。晴天气温高时，除早晚洒水外，中午要补洒一次水，保持相对湿度达到90％左右，在适宜的条件下，灵芝生长迅速，2个月后便可采收。
一般情况下，整根长段木埋土出芝，产量较低，并且多形成弯曲的畸形芝。如果越冬之后，将段木挖出并截成20厘米短段，再埋入土中，顶端露出1厘米，经科学管理后，新断面会长出更多的幼芝，有助于提高灵芝的产量。
