加工包装后的桔梗，需要一段时间的贮藏，在此过程中，海周围环境和自然条件等因素的影响，常会发生霉烂、虫变色、泛油等现象，导致桔梗变质，影响或失去疗效。因必须贮存和保管好桔梗，以保证其应有品质。
1.影响桔梗变质的因素
(1)外界因素:外界因素指空气、温度、湿度、日光、微物、昆虫等。桔梗在这些因素的综合作用下，常发生一些变质现象。如贮藏时的温度过高、贮藏时间过长或受日光照晒过长，与空气接触会引起药材走油;在定的温度和湿度下，会被微生物污染而生霉;通常温度在16-35C，相对湿度在60%以上，含水量在11%以上，会发生虫蛀;在空气、湿度、日光等因素的作用下会发生变色等。
(2)内在因素:内在因素指中药材所含化学成分的性质。中药材的成分不稳定，有的易被氧化或还原，有的有挥发性，有的在光照条件下易异构化而失去生物活性，有的在适宜的条件下由于酶的存在而易水解，有的含吸湿性成分致使药材吸湿后发生霉变等。因此在贮藏桔梗时，一定要选用适当贮藏方法，才能保证桔梗的品质。
2.常用的贮藏方法
贮藏时间短时，只需选择地势高、干燥、凉爽、通风良好的室内，将桔梗堆放好，或用塑料薄膜、苇席、竹席等防潮即可。
(1)防潮贮藏法:将石灰等吸水材料置于贮藏桔梗的室内，并不断更换吸水材料，使室内保持干燥。
(2)气调贮藏法:充氮降氧是利用氮气发生器，向密闭库内充氮气，使库内氧气浓度降低，从而杀灭害虫。据试验，密封仓库，充氮降氧，使库房内充满98%的氮气，害虫就窒息而死，而且库内桔梗不会发霉变质、变色，是一种科学而又经济的贮藏方法。
充氮降氧杀虫除掌握氧气的浓度外，还需控制环境温、湿度。因为不同温湿度对害虫致死率都不同。而且在保持一定氧气浓度的基础上，还需有一定的密封时间保证，一般氧气浓度在2%以下，温度在25~28C时，密封时间应为15~30天，这样才能有效地杀灭害虫。
(3)密封防潮贮藏法:地面铺木板，板上铺油毛毡和草席，再铺上大块塑料薄膜，桔梗堆放于薄膜上，用薄膜包装密封，并将接缝粘接起来。
