扦插在于成本低，只要品种好的，扦插苗根系好的，扦插是最好的选择，能够保持母本性状，但是扦插苗的也有缺陷，就是根系不够发达，所以还有一种比较好的选择就是嫁接苗，能够保持母本性状的同时，由实生苗提供地下部分，根系强。组培苗主要是繁殖一些扦插不容易成活的或者病害较严重的，通过脱毒，快速繁殖，好处在于可以通过组培进行植株脱毒，从而得到较好的母本，一般像菊花，草莓这些，会使用组培进行脱毒，快速繁殖。但是组培苗还需要练苗，等一些列管理，成本更高，所以到底要说哪个好，可能需要从成本、植株情况和繁殖难易度等来综合判断。
组培优势在于脱毒和有限资源可以大量繁殖，扦插的优势在于快速繁殖。对于一般的来说人来说，扦插更好。对于专业品种研发的人员来说组培更好。
组培的技术远远高于扦插的技术，组培一般成本比较大，需要的设施和条件比较苛刻。一般扦插成活率高的选择扦插，扦插成活率比较低的会选择组培。
它们之间谁好，需要站在什么角度来看。只能说它们各有所优吧。
