树桩盆景是具有四时变化和生命力的造型景观，日常维护对延续其生命生长至关重要。日常维护包括浇水、施肥、修剪、病虫害防治等。尽管山水盆景以山石为主，但因点缀了植物，同样需要养护管理。由于山石上栽植植物的土壤较少，生长条件受限，更需精心管理。
管理方法与树木盆景基本相同，但需特别注意喷水施肥和放置。喷水时，除在盆中贮满清水外，还需对整块山石经常喷水。吸水不良的硬质石料盆景上的植物全靠人工喷水养护，稍有疏忽就会枯萎。吸水性能好的松质石料盆景可适当减少喷水次数。
施肥方面，山石上的植物土少且不便换土，容易缺乏养分，需经常施肥。肥料宜选用稀薄液肥，便于浇施，或将山石浸透肥水后冲洗表面干净。
放置时，山水盆景上的植物一般较少且根浅，不宜暴晒或受寒。夏季需遮荫，放置半阴处；冬季需防寒，不宜放在室外。平时应置于光线充足、通风良好、便于观赏的场所。