荷花是水生植物，无水则不能生存。而怕水是指水位过高则难以开花，甚至全株死亡。因品种不同，对水深的要求也不同。如生长在武汉东湖的红莲，在水深1.5米时，只见几片浮叶，立叶已全部淹于水中，无立叶便不能开花。立叶淹没10天以上便有淹死之险，即使淹没3~5天，虽能维持生存，但当年不易开花。
适于荷花生长的水位一般不超过1米，中、小型花种则应在15~20厘米之间。生长季节如缺水，若泥土尚未干透（还湿润），及时灌水尚可恢复；若泥土已干至龟裂，则生长停滞，叶片枯焦，难以复生。
荷花虽依赖水生长，但不同生育期对水的要求不同。分栽莲藕时，水分不宜过多，待3~5天后泥面微龟裂时浇少量水，这样既能避免种藕漂浮，又可提高泥温，对早期生长有利。早期应保持浮叶和立叶出水为度，随立叶生长，逐渐提高水位。夏季气温高，生长迅速，缸栽1~2天加水1次；盆碗莲则需每天加水。秋末冬初新藕形成将进入休眠期，保持浅水即可，但不能无水，否则新藕受干会影响下年生长。荷花管理中水是关键，应遵循其生长规律。