液肥是将水草生长所需的营养物质溶解在水中，而根肥和基肥则是以固体形态存在的肥料。基肥中含有一定的有机质，其营养物质要靠这些有机质逐渐分解才能发挥出来，因此也叫长效肥。基肥适合在开缸时铺设在底床内使用。根肥的主要成分是无机肥，主要用于给根系发达的水草提供根部吸收的的养分。
很多水草根部吸收养分的能力要强于叶片，因此施加根肥的效果有时非常理想。基肥和根肥的作用是一样的，只不过肥效更为持久。
基肥在开缸时施加，液肥在日常维护中添加。根肥则根据水草的状态适时添加。大多数根肥不可当作基肥使用，否则由于其释放速度过快，会造成水草肥伤，并且有可能引发暴藻。
少数根肥具有缓释性，可以适量作为基肥使用，但肥效没有基肥持久~基肥的用量需要严格控制，并且要尽量分散。否则有机质的过度腐败会造成底床环境的严重劣化，严重时会造成水草的死亡以及藻类的泛滥。
