芍药和牡丹花的形态方面
叶片：
牡丹花的叶片较宽，芍药花的叶片较窄。牡丹花叶色呈现正面绿色反面淡黄色，芍药花叶色为黑绿色。牡丹花叶片下表面有白粉，芍药花叶片茂密，颜色亮，有蜡质光泽。牡丹花的叶片多为二回三出羽状复叶。
花朵：
牡丹花的花朵生于枝条顶端，多为单生，花径较长，有二十厘米；芍药花多为数朵丛生，花径多为十五厘米左右。牡丹花花型众多，有单瓣型、荷花型、菊花型、蔷薇型、皇冠型、绣球型等，而芍药花则没有众多花型。
芍药和牡丹花的生理方面
花期：
牡丹花的花期比芍药花要早，牡丹花一般在四月中下旬开花，而芍药花在五月份上中旬开花，花期相差约半个月。
根本区别：
牡丹是落叶灌木，属于木本植物，最高能长到两米多高；芍药属于宿根草本植物，最高不过一米。
最明显区别：
冬天时，牡丹花会有老的枝干留在地面，而芍药花的地上部分将会全部凋谢。