唐菖蒲的病害，发生于种球的有灰霉病和球茎腐烂病；发生于植株的有干腐病、叶斑病和锈病等。
防治应采取综合措施：
①淘汰带病种球；
②播种前应浸药消毒；
③避免连作栽培；
④勿淋水过多，不过量施用氮肥，多施磷、钾肥，增加球茎和植株的抵抗力；⑤及时拔除病株销毁；⑥经常喷射杀菌农药如托布津、多菌灵、百菌清等。
唐菖蒲虫害主要有三类：
①地下害虫，如地老虎、金龟子幼虫、蛀心玉米螟虫和线虫，防治可在土壤中每亩施入呋喃丹6－8公斤或施铁灭克1－1.5公斤或杀虫双水800倍淋头；
②为害叶片吮吸汁液的蚜虫、红蜘蛛、蝽象等，防治可喷氧化乐果、灭百可、克螨特、双果脒、托尔克等；
③咬食叶片的有牧草虫(排虫)、菜青虫、尺蠖、斜纹夜蛾、狗毛虫等，防治可用速灭杀丁、灭百可、氧化乐果、青虫灵等。
