日本晚樱树高3-8米，树皮灰褐色或灰黑色，有唇形皮孔。小枝灰白色或淡褐色，无毛。冬芽卵圆形，无毛。叶片卵状椭圆形或倒卵椭圆形，长5-9厘米，宽2.5-5厘米，先端渐尖，基部圆形，边有渐尖单锯齿及重锯齿，齿尖有小腺体，上面深绿色，无毛，下面淡绿色，无毛，有侧脉5-8对；叶柄长1-1.5厘米，无毛，先端有1-3圆形腺体；托叶线形，长5-8毫米，边有腺齿，早落。
日本晚樱花序伞房总状或近伞形，有花2-3朵；总苞片褐红色，倒卵长圆形，长约8毫米，宽约4毫米，外面无毛，内面被长柔毛；总梗长5-10毫米，无毛樱花的生命很短暂。在日本有一民谚说：“樱花7日”，就是一朵樱花从开放到凋谢大约为7天，整棵樱树从开花到全谢大约16天左右，形成樱花边开边落的特点。也正是这一特点才使樱花有这么大的魅力，花期大概在4~5月。
