银杏茎腐病，又叫苗枯病，是银杏苗期的主要病害，苗木受害主要发生在夏季（6至9月）。
主要特征
发病初期幼苗基部变褐，叶片失去正常绿色，并稍向下垂，但不脱落。感病部位迅速向上扩展，以至全株枯死。病苗基部皮层出现皱缩，皮内组织腐烂呈海绵状或粉末状，色灰白，并夹有许多细小黑色的菌核。此病病菌也能侵入幼苗木质部，因而褐色中空的髓部有时也见小菌核产生。此后病菌逐渐扩展至根，使根皮皮层腐烂。如用手拔病苗，只能拔出木质部，根部皮层则留于土壤之中。银杏扦插苗在高温或低温的条件下，茎腐病也能发生，可使插穗表皮呈筒状套在木质部上，韧皮部薄壁组织则全部发黑腐烂。
病害原因
天气炎热，土壤温度高，苗木茎基部受损伤后易引发此病。苗木木质化程度越低、发病率越高，地势低洼、长期积水的育苗地，苗木生长不良，发病更为严重。一般来说，病菌侵染自6月中旬开始，直至9月中旬才停止，7至8月为发病盛期。
防治方法
（1）提早播种，争取在土壤解冻时（3月上中旬）即行播种，待6月发病高峰到来之际，苗木已呈木质化，抗病力增强，抑制病菌，降低发病率。
（2）播种前后一定要时刻注意消灭地下害虫。
（3）防止苗木的机械损伤当年生播种苗或一年生移植苗在松土除草或起苗栽植过程中一定要注意不要损伤苗木的根茎,否则极易引起茎腐病的发生。
（4）灌水喷水在高温季节应及时灌水喷水以降低地表温度，有条件的地方可采取喷溉，更有利于减少病害的发生。
（5）整地时，每亩地施入50千克至100千克硫酸亚铁，或用2％至3％的硫酸亚铁溶液喷洒土壤。发病初期，可叶面喷洒1％至2％的硫酸亚铁溶液。5月下旬、6月上旬、6月中旬各喷一次50％多菌灵600至700倍液或甲基托布津800至1000倍液等。在喷药防治过程中，可喷一些植物叶面肥如特多收、爱多收、磷酸二氢钾等，提高植株抗病能力，有效防止银杏茎腐病扩散蔓延。
