马蹄莲根腐病多在马蹄莲临近开花时发生，严重影响生产效益。马蹄莲根腐病的主要症状为：一般是植株下部或外层叶片最先变褐枯萎，病害不断向内层叶片发展、蔓延。已开放的花，其顶端变褐色，有时这种褐色可一直发展到叶柄和花梗，花姿畸形。如将病株拔起，可见到很多根系已腐烂，剩下的根呈水渍状软腐，仅留下表皮，呈中空管状。病害从吸收根逐渐向根状茎蔓延，最后根状茎呈海绵状干腐。
马蹄莲根腐病主要是由真菌中的隐地疫霉菌侵染引起的。病菌在土壤内存活，是一种由土壤传播的危害，简称土传播病害。
目前防治马蹄莲根腐病有以下两种常用方法：
方法1、根状茎消毒。彻底切除根状茎上的病斑，待干燥后，再用50摄氏度温水浸泡1小时，或用1%过乙酸溶液浸泡10分钟后再栽植。经过消毒处理的根状茎比未经处理的开始生长较慢，因此，最好提前半个月种植。
方法2、土壤消毒。病土和盆钵须热力灭菌后，方能再用。也可用70%土菌消可湿性粉剂配成0.4%浓度喷洒土壤，但必须在种植前处理。
