鸡苗的免疫系统在孵化后的一段时间内较为脆弱，需要通过逐渐成熟来应对外部病原体的侵袭。一般而言，鸡苗在孵化后的2周到4周之间逐渐建立起自身的免疫系统。因此，第一次接种禽流感疫苗的最佳时间是在鸡苗孵化后的第三周。
在第三周接种疫苗，鸡苗的免疫系统已经相对成熟，能够对疫苗产生有效的免疫反应。这有助于提高鸡苗对禽流感病毒的抵抗力，减少感染的风险。
禽流感疫苗通常分为活疫苗和灭疫苗两种类型。活疫苗能够在鸡体内复制繁殖，刺激免疫系统产生更强的免疫反应；而灭疫苗不会在鸡体内复制，但仍能刺激免疫系统产生免疫反应。根据具体情况，养殖户可以选择适合自己鸡苗的疫苗类型。