玉米丝黑穗病的主要症状表现为果穗整体变为黑粉包，由丝状寄主维管束组织构成，果穗基部粗大，顶端尖锐，整体短小，呈近球形，不吐花丝。此外，雌穗颖片可能因病菌侵染而过度生长，形成管状长刺，形似刺猬头，长刺中央空松，下粗上细，长度不一。
