夏孢子是导致小麦秆锈病的主要原因，当温度在3-31℃时小麦可感染秆锈病，当温度在18-22℃时小麦感染秆锈病的概率最高。种植对秆锈病抵抗力低的小麦品种、气温高、降水量多也是小麦秆锈病的诱因。栽培管理措施如播期、密度、水肥管理等对麦田小气候、植株抗病性以及小麦秆锈病的发生有很大的影响。在中国北部麦区播种过晚，小麦秆锈病发生重；麦田管理不善，追施氮肥过多、过晚，则加重小麦秆锈病发生。有些小麦品种对病害的抵抗力较弱，或者长期种植单一品种，易发生小麦秆锈病。高湿多雨的天气也会加剧病害发生。田间管理措施不到位，导致小麦苗长势弱，抵抗能力下降，容易感染秆锈病。此外，小麦秆锈病的菌源数量越多，发病概率越大。
