大豆紫斑病会显著影响作物产量，严重时可导致减产超过20%。染病植株叶片会提早老化，同时种子也会受到感染，造成重量减轻0.7-10%不等。此外，种子的发芽率下降，导致田间保苗数减少，保苗率降幅在10.5-52.5%之间。
