防治大豆根腐病的方法包括：
1.种子处理。
2.深翻土壤，加速病残体的腐烂分解。
3.深沟高畦栽培，确保雨停后不积水。
4.提倡轮作，最好进行水旱轮作。
5.使用充分腐熟的有机肥，并确保不混有上茬作物残体及腐烂物。
6.选用抗病、包衣的种子，如未包衣，则使用拌种剂或浸种剂进行灭菌。
7.合理密植，及时去除病枝、病叶、病株，并带出田外烧毁，病穴施药或生石灰。
8.采用地膜覆盖栽培，可防治土中病菌危害地上部植株。
9.适当增施磷钾肥。
此外，可使用70%恶霉灵可湿性粉剂1000-2000倍液、10%双效灵水剂300倍液、50%多菌灵可湿性粉剂800-1000倍液进行浇灌施用。