芝麻的主要病虫害有茎点枯病、枯萎病、青枯病、立枯病、疫病、病毒病、叶斑病、花叶病、蚜虫、甜菜夜蛾、小地老虎、芝麻天蛾、盲蝽等。其中以茎点枯病、枯萎病、青枯病、立枯病、疫病、病毒病、叶斑病等危害较重而普遍。