胡萝卜细菌性软腐病主要危害肉质根。地下部肉质根多从近地表根头部发病，以后逐渐向下蔓延扩大，病斑形状不定，周缘明显或不明显，褐色，水浸状湿腐。地上部茎叶在慢性发病时，黄化后逐渐萎蔫；急性发病时，则整株突然萎蔫干枯。随病部扩展，肉质根组织变灰褐色软化腐烂，外溢黏稠汁液，散发出臭味。严重时整个肉质根腐烂。在田间，感染的胡萝卜茎叶变黄枯萎，根系感染先是湿腐、再膨胀，病斑形状大小不一，周边明显或模糊；肉质根表面有污点，不断扩展成不规则、水渍和褐色斑点。当湿度较高时，病变处有白色蜘蛛丝状菌丝，病变处也软化和腐烂；如果严重，会整个肉质根腐烂。
