马铃薯黑痣病以菌核在块茎或土壤中越冬，或以菌丝体在土壤中的残体上越冬，病菌可在土壤中存活2-3年。第二年春季，当温度、湿度合适时，菌核萌发侵染马铃薯幼芽、根、地下茎、匍匐茎、块茎。带病种薯是翌年的初侵染源，也是远距离传播的主要载体。马铃薯生长期间病菌从土壤中根系或茎基部伤口侵入，引起发病。该病发生与春潮及潮湿条件有关，播种早或土温较低发病重。病菌侵入的主要手段是直接或经伤口侵染其幼芽，导致幼芽病变，最终造成病苗；生长期主要因灌水、昆虫和农事操作等对植株造成创伤而被病菌侵入；生长后期产生菌核越冬。发病高峰期一年中有2次，分别为苗期至现蕾期和开花期至结薯期。
