褐纹病的病原主要以菌丝体或分生孢子器在土表的病残体上越冬，同时也可以菌丝体潜伏在种皮内部或以分生孢子粘附在种子表面越冬。病菌的成熟分生孢子器在潮湿条件下可产生大量分生孢子，分生孢子萌发后可直接穿透寄主表皮侵入，也能通过伤口侵染。病苗及茎基溃疡上产生的分生孢子为当年再侵染的主要菌源，然后经反复多次的再侵染，造成叶片、茎秆的上部以及果实大量发病。病菌主要在土壤中的病残体上越冬，第二年可直接侵染幼苗的茎或根，或经雨水喷溅到近地面的果实上引起果实发病。病斑上的孢子襄，经风雨、浇水进行再侵染。
当田间气温28～30摄氏度，相对湿度高于80%，持续时间比较长，或连续阴雨，此病易流行。此外，多年连作，土壤黏重，排水不良，播种过密。植株生长较弱，均有利于病害发生。发病环境，温度为28-30℃，相对湿度95%以上；最适感病生育期苗期、开花座果盛期至采收期中后期。分生孢子器形成适温为30℃，分生孢子形成适温为28-30℃，发芽适温为28℃。种子带菌是幼苗发病的主要原因。品种的抗病性也有差异。该病是高温、高湿性病害，降雨期、降雨量和高湿条件是茄褐纹病能否流行的决定因素。