1.因地制宜，适期早播，是防治该病最基本的方法。2.用次氯酸钠浸种。在浸种前先用0.2%~0.5%的碱液清洗种子，再用清水浸种8~12小时，捞出后置入配好的1%次氯酸钠溶液中再浸5~10分钟，冲洗干净后催芽播种。也可用咯菌腈进行种子包衣。3.加强田间管理。防止菜地积水；注意施用腐熟有机肥。4.发病前喷淋或灌锌柠·络氨铜可湿性粉剂800倍液、50%氯溴异氰尿酸可溶性粉剂1000倍液、20%二氯异氰尿酸可溶性粉剂300~400倍液，隔10天左右1次，连续灌2~3次。选用抗病品种，小量多次浇水，避免水量过多。首先要在定植之前给土壤消毒，再次选择抗病品种。辣椒的根腐病用菌克毒克，叶面喷洒就可防治。
