番茄软腐病主要为害果实和茎。茎部染病，主要从整枝打杈造成的伤口侵染，严重的髓部腐烂，失水后病组织干缩中空，病部维管束完整，病茎上端枝叶萎蔫，叶色变黄。果实染病保持完整，果肉腐烂，具恶臭，是番茄软腐病的特征之一。茎部多从整枝伤口处开始，继而向内部延伸，最后髓部腐烂，有恶臭，失水后，病茎中空。主要侵染茎和果实。茎发病多出现在生长期，近地面茎部先出现水渍状污绿色斑块，继扩大的圆形或不规则形褐斑，斑周显浅色窄晕环，病部微隆起。果实感病主要在成熟期，初期病斑为圆形褪绿小白点，继变为污褐色斑。随果实着色，成熟度增加及细菌繁殖为害，果皮病斑渐扩展到全果，但外皮仍保持完整，内部果肉腐烂水溶，恶臭，被盛于皮囊中，故称囊腐。防治方法是加强田间管理，整枝抹芽宜早。
