西葫芦主要病害有:炭疽病、银叶病、软腐病、细菌性叶枯病、白粉病、灰霉病、霜霉病、病毒病、绵腐病、菌核病、蔓枯病、褐色腐败病、黑星病、绵疫病等。主要虫害有:白粉虱、潜叶蝇、红蜘蛛等。
西葫芦病毒病有三种类型。一种是花叶型，病叶的症状为叶片上呈现黄绿相间的花斑，叶面凹凸不平，新生叶片畸形，茎蔓的前端节间短缩。另一种是蕨叶形，症状表现为植株矮化，叶片皱缩、扭曲，新生叶片狭长，呈鸡爪状或线状。第三种为混合型，表现为兼有花叶、蕨叶两种病症，发病植株表现为生长发育不良，花发育不好，难以坐瓜。即使坐瓜，长成的瓜也较小，瓜面有瘤状突起，失去食用价值。病毒主要通过种子传播，蚜虫和守瓜等昆虫传毒和汁液接触传染，高温、干旱是发病的主要条件。
西葫芦病害还包括：西葫芦白粉病、西葫芦灰霉病、西葫芦绵腐病、西葫芦菌核病、西葫芦黑星病、西葫芦疫病、西葫芦瓜(花)腐病、西葫芦花叶病等。瓜虫害（黄瓜、西葫芦、南瓜、丝瓜、冬瓜）有：美洲斑潜蝇、瓜蚜、温室白粉虱、黄足黄守瓜、黄足黑守瓜、瓜绢螟、葫芦夜蛾、瓜实蝇、棕榈蓟马、黄蓟马、绿盲蝽、红脊长蝽、朱砂叶螨、二斑叶螨、烟粉虱等。