甜瓜枯萎病病茎百分之百带菌，种子也带菌。该病以病茎、种子或病残体上的菌丝体和厚垣孢子及菌核在土壤和未腐熟的带菌有机肥中越冬，成为翌年初侵染源。在土壤里病菌从根部伤口或根毛顶端细胞间侵入，后进入维管束，在导管内发育，并通过导管，从病茎扩展到果梗，到达果实，随果实腐烂再扩展到种子上，致种子带菌。生产上播种带菌的种子出苗后即可染病；在维管束中繁殖的大、小分生孢子堵塞导管、分泌毒素，引起寄主中毒，使瓜叶迅速萎蔫。地上部的重复侵染主要通过整枝或绑蔓引起的伤口。该病发生严重与否，主要取决于当年的侵染量。高温有利于该病的发生和扩展，空气相对湿度90%以上易感病。病菌为菌丝体、菌核、厚垣孢子在土壤、病残体或未经高温腐熟的肥料中越冬，也可以在种子上越冬，成为第二年的初侵染源。病株茎基部表面所见粉红色霉层是病菌的菌丝体、分生孢子和厚壁孢子。①选择地势高燥，灌排方便的地块种植。②与非瓜类作物轮作，可降低病害。③施用腐熟好的有机肥，适当增施磷、钾肥，控制氮肥用量。④清洁田园，将病残体集中于田外烧毁。残留在土壤中的病菌翌春侵入瓜苗，在高温高湿下迅速扩展。
