磷缺乏的第一症状是整株植物矮小，叶片形状可能扭曲。严重缺磷时，表现部位上可能出现坏死区。缺磷时，老叶先受影响，特别是低温时，缺磷植株常见发紫或发红，茎杆呈紫红色，失去光泽。缺磷症状在苗期最为明显，植株生长缓慢、瘦弱，茎基部、叶鞘甚至全株呈现紫红色，叶尖和叶缘出现黄色，严重时叶尖枯萎呈褐色。幼嫩植株表现尤为严重。随着生长，下部叶片由紫红色变成黄色。抽穗吐丝延迟。缺磷影响玉米授粉和子粒灌浆，玉米果穗小，秃尖，易弯曲，行列不整齐，子粒也不饱满，成熟期推迟。
苗期缺磷时，根系发育差，玉米苗生长缓慢、瘦弱。但是，叶上的这种症状也可能因虫害、冷害和涝害而引起，所以要作全面分析。缺磷还使抽雄时花丝抽出速度缓慢，影响雌穗授粉，并且果穗短小、卷缩，穗行不齐，籽粒不饱满，出现秃尖现象，成熟期延迟。首先下部叶片尖部干枯，从叶尖叶缘向基部蔓延，叶片糖分积累，形成花青素，呈紫红色，进而呈暗褐色，逐渐向上部幼嫩叶片发展；植株生长缓慢，叶片皱缩，根系发育不良，茎部衰弱，细长；花丝延迟抽出，受精不良，雌穗发育差，穗顶缩短，秃尖，缺粒，粒行不整齐，甚至空穗。
玉米缺磷嫩株敏感，植株矮化，叶尖叶缘失绿呈紫红色。，后叶端枯死或变成暗紫褐色。幼苗期缺磷，茎和叶片暗绿带紫红色，从下部叶片开始，先是叶尖干枯，沿叶缘相基部蔓延，进而呈暗褐色。以后逐渐向幼嫩叶片发展，根系发育不良，茎部衰弱，细长。孕穗至开花期缺磷，糖代谢与蛋白质合成受阻，雌穗减少，分化发育不良，花丝延迟抽出，授粉受阻使受精不良，籽粒不充实甚至空穗，并且会出现果穗卷曲，穗顶缢缩，会出现秃顶，缺粒缺行不整齐。
玉米苗期缺磷，茎和叶片暗绿带紫红色，从下部叶片开始，先是叶尖干枯，沿叶缘向基部蔓延，进而呈暗褐色，以后逐渐向幼嫩叶片发展。根系发育不良，茎部衰弱，细长。孕穗至开花期缺磷，糖代谢与蛋白质合成受阻，雌穗减少，分化发育不良，花丝延迟抽出，授粉受阻，使受精不良，籽粒不充实，甚至空穗。果穗卷曲，穗顶缢缩，会出现秃顶、缺粒与粒行不整齐现象。玉米缺磷症状表现为植株矮小，叶尖、叶缘失绿呈紫红色，后叶端枯死或变成暗紫褐色，植株矮化，根系不发达，雌穗授粉受阻，籽粒不充实，果穗少或歪曲。玉米缺磷在幼苗期和开花期都会出现不同的症状，幼苗期缺磷玉米下部叶片开始出现暗绿色，并且从边缘开始出现紫红色；开花期缺磷秃顶、缺粒与粒行不整齐等症状。