玉米苗期的主要病害是腐霉菌、串珠镰刀菌引起的猝倒病、苗枯病和根腐病等。苗期对玉米危害严重的地下害虫有蝼蛄、蛴螬、地老虎、金针虫等。玉米虫害有红蜘蛛、蚜虫、玉米螟。病害有丝黑穗病、瘤黑粉病、顶腐病、大斑病、小斑病、纹枯病、霜霉病等。通过轮作倒茬，适期播种，春播浅覆土，减少病害发生。种子包衣是预防丝黑穗病、瘤黑粉病和地下害虫的基本措施。6月份顶腐病发生初期用40%琥胶肥酸铜600倍液喷雾。抽雄后及时用50%甲基托布津700倍液，或70%百菌清1000倍液预防瘤黑粉病、大小斑病等。田间出现瘤包及时清除销毁。做好中耕除草工作，拔节期用除草可有效减轻红蜘蛛、夜蛾、玉米螟等危害。抽雄前后用0.5Be的石硫合剂400倍液喷雾防治红蜘蛛、蚜虫。在小喇叭口期用呋喃丹颗粒放到喇叭口内，防止玉米螟侵入。
