玉米丝黑穗病的发生程度与品种的抗病性、土壤中的病菌数量、环境条件有关。不同玉米品种在同一条件下发病率不同，表明品种间抗病性存在差异。玉米种植至出苗期间的土壤温、湿度条件与发病关系最为密切。在土壤温度20℃左右、土壤含水量20-40%时，玉米发芽生长迅速，约6-10天即可出苗，缩短了幼芽在土壤中的停留时间，减少了病菌感染机会，发病较轻。当土温在15℃左右、土壤含水量低于20%时，不利于种子萌发和生长，出苗缓慢，延长了幼芽在土壤中的停留时间，增加了病菌感染机会，发病较重。早播和播种过深、种植感病品种、连作地块土壤病菌数量大、春季低温干旱年份玉米丝黑穗病发病重。
