黄瓜为雌雄同株植物。雄花通常数朵在叶腋簇生，花梗纤细，长0.5-1.5厘米，被微柔毛；花萼筒狭钟状或近圆筒状，长8-10毫米，密被白色长柔毛，花萼裂片钻形，与花萼筒近等长；花冠黄白色，长约2厘米，裂片长圆状披针形；雄蕊3，花丝近无，花药长3-4毫米，药隔伸出长约1毫米。雌花单生或稀簇生，花梗粗壮，被柔毛，长1-2厘米；子房纺锤形，粗糙，有小刺状突起。黄瓜的叶子长在藤蔓上，较大，背面有毛刺，正面光滑。在叶子和藤蔓连接处会长出带毛的小黄瓜，其顶端即为花。果实为长圆形或圆柱形，长10-30(-50)厘米，熟时黄绿色，表面粗糙，有具刺尖的瘤状突起。种子狭卵形，白色，无边缘，两端近急尖，长约5-10毫米。花果期夏季。
