油菜菌核病是真菌病害，防治用真菌绝杀效果很好。菌核病主要在油菜结实期发病严重，要预防菌核病，应选用抗病良种进行播种，并喷施恶霜菌酯水剂进行预防。发病初期及时喷淋甲基立枯磷乳油或农利灵可湿性粉剂进行治疗，可交替用药。及时摘除老黄病叶，开花后期摘除下部老黄脚叶、病叶，少数生长过旺的田块，可提前到盛花期进行。
油菜菌核病防治方法：根据菌核病发生为害特点，应以农业防治和药剂防治为主。采用配方施肥技术，提倡施用酵素菌沤制的堆肥或腐熟有机肥，避免偏施氮肥，配施磷、钾肥及硼锰等微量元素，防止开花结荚期徒长、倒伏或脱肥早衰，及时中耕或清沟培土，盛花期及时摘除黄叶、老叶，防止病菌蔓延，改善株间通风透光条件，减轻发病。合理施肥适当控制氮肥的施用，补施磷钾肥，使油菜苗期健壮，苔期稳长，花期茎秆坚硬。药剂防治，油菜栽培区重点抓两次防治。