小麦锈病防治以预防为主，结合园艺措施、生态调控等措施，并适时科学施用高效低毒低残留农药防治。加强监测，发现一点，防治一片，及时控制发病中心，防止病害蔓延。
农业防治方面，可选用抗病品种，生长中增施磷、钾肥，并注意及时排水降低湿度。药剂防治方面，在播前使用粉锈宁进行拌种后播种，在发病初期喷施三.唑.酮可湿性粉剂或丙环唑进行喷施防治。
30%苯甲·丙环唑乳油是由苯醚甲环唑和丙环唑两种杀菌剂混配而成，具有内吸性和较长持效性等特性，施药后能被叶片迅速吸收。在发病初期使用，可用30%苯甲·丙环唑乳油15-20克/亩，兑水30公斤后对全株均匀喷雾，隔10-15天进行第二次施药，可迅速控制锈病的继续危害。