木瓜炭疽病病菌以菌丝体潜伏于病虫枝、瘦弱枝芽及僵果里越冬。翌年春,越冬病菌形成分生孢子,为初次侵染源,在适宜条件下,经皮孔直接侵入果实。分生孢子借风雨及昆虫传播,遇水湿萌发,经气孔、伤口或直接由表皮侵人,辗转为害。高温、高湿是此病流行的主要因素。