种子和田间病残体上的病为苗期的主要侵染来源。一般感病较重的种子，常常不能出土就腐烂而死。病轻者可出苗，但生长衰，病组织及残体所产生的分生孢子或子囊孢子借风雨传播，直接侵入或由伤口和气孔侵入寄主，如温度和湿度条件适宜，发病后不久病斑上便又产生分生孢子或子囊孢子，进行多次再侵染，致使时上产生大量病斑，干枯死亡。尽管多数叶枯病菌在整个生有期均可为害，但以抽穗后发生较重，是主要为害时期。
小麦叶枯病菌在春麦区以分生孢子器及菌丝体在小麦病残体上越夏、越冬，到第二年春天，当环境条件适宜时，分生孢子器吸水后即释放出分生孢子，借风、雨传播引起初侵染。冬麦区，病菌在小麦病残体或种子上越夏，秋季侵入麦苗，以菌丝体在病株上越冬。病株上产生的分生孢子可借风、雨传播，进行再次侵染。据报道，禾本科杂草寄主可能是病菌的重要越夏场所。在新西兰、澳大利亚和英国等国家，子囊孢子可借风、雨传播，侵染早期麦苗，成为重要的初染源，其对产量的影响比分生孢子后期侵染植株上部叶片的作用更大。分生孢子和子囊孢子的芽管可直接或通过气孔侵入小麦[1]。
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