黄瓜炭疽病病菌以菌丝体、拟菌核随病残体在土壤中越冬,种子也可带菌。病菌还可在温室、大棚木骨架上腐生存活。越冬后便产生大量的分生孢子,成为初侵染源。在田间,分生孢子借风、雨、昆虫及农事操作进行传播,主要是通过雨水、灌溉、气流传播。