南瓜白粉病主要危害叶片，也为害叶柄和茎蔓。发病初期在中下部叶正面或反面产生白色近圆形小粉斑，逐渐向外围发展成较大粉斑，随病情发展粉斑可布满整个叶片，似撒了一层白粉。以后发病叶片病部组织褪色变黄，最后呈褐色坏死，粉斑颜色亦随病害发展而变深。有时，后期病叶上还形成褐色，逐渐变为深褐色的小粒点。茎蔓和叶柄不及叶片症状明显，但病害严重时可同时产生许多粉状病斑，终致植株早衰死亡。发病初始在叶面或叶背产生白色粉状小圆斑，后逐渐扩大为不规则形，边缘不明显的白粉状霉层粉斑，白色粉状物即为病菌的分生孢子梗和分生孢子及无色透明的菌丝体。发生严重时，多个粉斑可连接成片，甚至布满整张叶片。发病叶片的细胞和组织被侵染后并不迅速死亡，将病部粉层抹去，一般只表现为褪绿或变黄。发病中后期白色粉状霉层老熟，呈灰色或灰褐色，上有黑色的小粒点，即病菌的闭囊壳，发病末期病叶组织变为黄褐色而枯死叶柄和茎染病，密生白粉状霉层，霉层连接成片。苗期、成株期均可发病。植株生长后期受害重，主要危害叶片、叶柄或茎;果实受害少，初在叶片或嫩茎上出现白色小霉点，后扩大为1-2cm霉斑，条件适宜，霉斑迅速扩大，且彼此连片，白粉状物布满整个叶面，致叶片黄枯或卷缩，但不脱落，秋末霉斑变成灰色，其上长出黑色小粒点，即病原菌闭囊壳。
