轮作倒茬可以通过和禾本科作物进行轮作3年以上，减少田间病菌的数量，能很好的起到预防效果。在播种前选择抗病性矫情的品种进行播种，可以大大降低感染该病害的几率。针对田间掉落的叶片、茎杆或是豆荚等病残体，要及时的清理出田外，可以有效破坏病菌的生存空间，减少病菌的数量。但注意清除工作最好等到大豆收获后进行。当遇到连阴雨天气，田间有积水时，要及时进行排水，尤其是低洼的地块，不能让田间长时间有积水，减少病害的发生和危害。对发病的地块进行深耕，将菌核深埋在土壤中，抑制菌核萌发，减少侵染来源；派水不良的地块，应平整土地及时派水，降低大豆田间湿度；在封垄前即使中耕培土，破坏萌发的子囊盘；适当地控制氮肥量，增施钾肥。病田收获后，应将病残体收集烧毁，消灭菌源。
