无花果根腐病的防治方法如下：
1.无花果的苗床、定植穴内要定期地使用多菌灵等药剂进行土壤消毒。
2.在无花果植株进行插穗之前，可以用相应的药液对枝穗的基部进行浸泡消毒处理，浸泡时间大概一个小时左右，然后再进行扦插。
3.如果是已定植的无花果幼苗感染了根腐病后，可以施用对应的药剂进行无花果植株灌根。冬季清园，及时拔除病株，带出田间，集中烧毁或深埋，以防止病菌越冬来年继续危害。对危害较轻的根系进行修剪培土，清理沟渠，防治堵塞。
4.发病初期，喷施40%多菌灵可湿性粉剂，一周两次，连用三次。对无花果苗床和种植坑进行撒生石灰，或石灰溶液浇灌消毒。
5.育苗期用40%福尔马松喷洒。定植幼苗染病后，可以使用相应药剂甲基立枯磷、甲霜铜、枯草芽孢杆菌等药剂加入萘乙酸类药物配制成溶液，一周一次进行无花果植株灌根防治，连续几周浇灌根系基本就可以治愈了。
6.采用先进科学的农业培管措施，有目的地创造有利于生长结果的环境条件，增强长势，提高抗性；同時创造不利于病虫害发生发展的抑制条件和减轻病虫草害危害的程度。这是最经济、最基础的防治措施。