1、选育抗病品种。2、合理施肥：采用配方施肥，增施磷钾肥，避免偏施氮肥，以提高植株的抗病性。3、栽培措施。适当早播，合理密植，中耕松土，适量浇水，雨后注意排渍降湿，必要时喷施叶面营养剂，创造有利于作物生长发育的良好环境，提高植株的抗病能力，减少病害的发生。4、药剂防治。使用化学药剂的作用是抑制孢子萌发和防治病害。在玉米锈病的发病初期用药防治。5、玉米收获后。收集并烧毁病株残体，以减少侵染来源。
玉米锈病可用烯唑醇、戊唑醇、氰烯菌酯等药物防治。
可以直接用粉锈宁，萎锈灵，多菌灵，石硫合剂等药剂防治。