苗期至成株期均可受害。叶片病斑近圆形，边缘分界不明晰，黑褐色，具轮纹。后期病斑常扩展成不规则形。叶柄、茎蔓病斑黄褐色，椭圆或近圆形，稍凹陷。果实病斑初呈水渍状，圆形或不定形，凹陷。湿度大时，各病部可溢出近粉红色粘液，即病菌分生孢子盘及分生孢子。
子叶上病斑半椭圆形，多发生于子叶边缘，淡褐色，微具轮纹，上生小黑点；幼苗靠地面的茎基部变黑褐色，细缩折倒；叶上病斑圆形，直径2～7mm，红褐色，周围常有黄色晕圈；主蔓和叶柄上病斑椭圆形，褐色，稍凹陷，包围主蔓植株枯死；果实上病斑圆形，初呈淡绿色，后变黑褐色，稍凹陷，上生小黑点，天气潮湿时密生橙红色点状黏质物。菌落不规则形。
幼苗发病，子叶边缘出现褐色半圆形或圆形病斑，茎基部受害，患部缢缩，变色，幼苗猝倒。成株期发病，茎和叶柄上，病斑呈长圆形，稍微凹陷，初呈水浸状，淡黄色，后变成深褐色，病斑环切茎蔓、叶柄一周时，上部即枯死。
丝瓜疫病主要危害果实，有时丝瓜茎蔓及叶也受害。果实发病多从花蒂开始，病斑凹陷，初为水渍状暗绿色，湿度大时瓜很快软腐，并有白色霉状物。严重时可侵染叶片、茎和瓜条。茎蔓发病主要在嫩茎或节间部位，初为水渍状，扩大后整段湿腐，暗褐色。叶片发病，初为水渍状黄褐色斑，湿度大时着生白色霉病，干燥时呈青白色，容易破碎。病原为鞭毛菌亚门真菌，寄生性疫霉菌，病菌可在种子和病残体上以菌丝或卵孢子传播。