小麦锈病药物防治可用多菌灵、粉锈宁、氰烯菌酯等。生物农药防治小麦条锈病有三个施药阶段：苗期每亩用1000亿芽孢/克枯草芽孢杆菌可湿性粉剂15-20克，对水后均匀喷雾，兼防赤霉病、白粉病；返青拔节期或条锈病发生初期，每亩用2%嘧啶核苷类抗菌素（农抗120）水剂333-500克，对水均匀喷施，隔7-10天喷1次，视病情喷施2-3次；发病前的拔节期至抽穗期或条锈病发病初期，每亩用短小芽孢杆菌QST2808菌株可湿性粉剂333-533克，对水均匀喷施叶面。小麦条锈病防治，选用抗病品种，增施有机肥和磷钾肥，清除病残体，合理密植，加强肥水管理，用笨醚甲环唑等农药拌种，发病初期用已唑醇等农药喷施防治。速效氮肥不宜施得过多、过迟，防止小麦贪青晚熟，加重受害。合理灌溉，壤湿度大或雨后注意开沟排水，后期发病重的需适当灌水，减少产量损失。
