实行检疫，严禁无病区从病区调种，以免扩大蔓延。选用适合当地种植的抗病丰产良种。播种前种薯处理：种薯出窖后进行晾种或催芽，剔除病薯，选用健薯；进行整薯播种，如需切块，切刀必须进行严格消毒，可用0.2％升汞水或0.1％高锰酸钾液等浸渍，做到切一块消毒1次；药剂处理种薯用50％托布津可湿性粉剂500倍液或1000倍的升汞水溶液浸泡种薯2小时，然后晾干播种。及时拔除销毁病株，以减少病源。安全贮藏，种薯经过精选、单藏等工作。
栽培管理：施用磷酸钙作种肥，在开花后期，加强田间检查，拔除病株及时处理，防治田间地下害虫，减少传染机会。药剂防治：播种前用3%中生菌素拌种，有一定的防治效果。杀秧后喷雾氢氧化铜，可以较好保护地下薯块。马铃薯环腐病主要是种块用甲环唑杀菌剂拌种，内吸传导。