黄瓜收获后及时清除病残体，集中烧毁或深埋，同时喷洒消毒药剂对土壤进行消毒，并配合喷施新高脂膜增强药效，大大提高药剂有效成分利用率。选用无病新土育苗，采用营养钵或塑料套分苗。与非瓜类作物实行5年以上的轮作，并在播种前用新高脂膜拌种能驱避地下病虫，隔离病毒感。
该病以为害植株茎部维管束为主。未出苗前染病造成烂秧，出土后子叶变黄、萎蔫或全株枯死。茎基部或茎部变褐缢缩或呈立枯状；成株期发病导致维管束变褐，主蔓茎基部纵裂，湿度大时表面有白色或粉红色霉层，并有少许琥珀色胶质物溢出。感病初期，单侧叶片或植株中午萎蔫下垂，似缺水状，萎蔫症状早晚恢复，后萎蔫叶片不断增多，遍及全株，致整株枯死。
一般在育苗的中后期发病，主要危害幼苗或地下根茎基部部，初期在下胚轴或茎基部出现近圆形或不规则形的暗褐色斑，病部向里凹陷，扩展后围绕一圈致使茎部萎缩干枯，造成地上部叶片变黄，最后幼苗死亡，但不倒伏。根部受害多在近地表根颈处，皮层变褐或腐烂。在苗床内，发病初期零星瓜苗白天萎蔫，夜间恢复，经数日反复后，病株萎蔫枯死，早期与猝倒病相似，但病情扩展后，病株不猝倒，病部具轮纹或稀疏的淡褐色蛛丝状霉，且病程进展较慢，有别于猝倒病。
多在开花结果后陆续发病，被害株最初表现为部分叶片或植株的一侧叶片中午萎蔫下垂，似缺水状，早晚可以恢复，以后萎蔫叶片不断增多，逐渐遍及全株，早晚不能复原，并很快枯死。病株主蔓基部纵裂，纵切病茎，可见维管束变褐。茎基部、节和节间出现黄褐色条斑，常有黄色胶状物流出，潮湿时病部表面产生白色至粉红色霉层。病株易被拔起。