玉米矮花叶病，应从抗病品种选育，防治蚜虫、灰飞虱入手。可选用20%正业吡虫啉3000-4000倍液+新高脂膜配合使用防治传毒害虫。对于病害的防治，可选用病毒克1000倍液+植物细胞满意因子喷雾提升植物抗逆性，使病毒DNA断裂凋亡，增强免疫功能，诱生干扰素和活性细胞介素，抑制残余病毒复制，促进植物正能量生态生长。
选用抗逆能力强、适应性广的多抗品种是防治生理性病害的最有效措施。加强田间管理，及时消除病变劣株、弱株，增强单株健壮性，提高植株抗逆境能力。适时灌水，增施有机肥，保证玉米植株发育良好、健壮生长、环境适宜。玉米生长前期、中期进行中耕、培土，增强根系吸收能力。及时中耕、消灭杂草，收获后深翻土壤，也可减少和控制浸染源。