南瓜病毒病是南瓜种植过程中常见的病害之一，主要危害南瓜的叶片。病毒主要表现叶绿素分布不均，叶面出现黄斑或深浅相间斑驳花叶，有时沿叶脉叶绿素浓度增高，形成深绿色相间带，严重的致叶面呈现凹凸不平，脉皱曲变形。一般新叶症状较老叶明显。病情严重的，茎蔓和顶叶扭缩。果实染病出现褪绿斑。开花结果后病情趋于加重。
南瓜病毒病发病症状包括：
①花叶型：叶片上出现黄绿相间的花叶斑驳，叶片成熟后叶小，皱缩，边缘卷曲。果实上表现为瓜条出现深浅绿色相间的花斑。
②皱叶型：多出现在成株期，叶片出现皱缩，病部出现隆起绿黄相间斑驳，叶片边缘难于开展，同时叶片变厚、叶色变浓。
③蕨叶型：南瓜植株生长点新叶变成蕨叶，成鸡爪状。果实受害后果面出现凹凸不平、颜色不一致的色斑，而且果实膨大不正常。