辣椒植株的任何部位都会感病，幼苗期，成株的叶片、茎部、果实均可受害。幼苗发病，茎基部呈水渍状软腐，其上部呈暗绿色而倒伏；叶片发病，病斑暗绿色，迅速扩大，使叶片一部分或大部分软腐，干燥后病斑变为淡褐色；茎部受害，病状与叶上相似，常易从病部折断；果实受害，病斑呈暗绿色水渍状而软腐，干燥后变成淡褐色而枯缩。辣椒疫病从苗期至成株期均可被侵染，茎、叶和果实都能发病。苗期发病首先在茎基部形成暗绿色水渍状病斑，迅速褐腐缢缩而猝倒，有时茎基部会呈黑褐色，严重时幼苗会枯萎死亡；成株期若叶片感病则会出现圆形或近圆形病斑，边缘为黄绿色，中央为暗褐色；椒果发病多从蒂部开始，病斑为水渍状，暗绿色，扩大后可遍及整个椒果，潮湿时椒果表面会产生霉层。
