玉米瘤黑粉病在玉米的整个生育期均可发病，尤其在抽雄前后发病严重。该病主要危害玉米的茎、果穗、雄穗等幼嫩组织，初期产生银白色瘤状物，有光泽，内部白色多汁。随着病情发展，肿瘤逐渐长大，表面变暗，内部变为灰色或黑色，最终炸裂，大量黑粉随风散出。叶片上的肿瘤较小，常多个成串散生；果穗上的肿瘤较大，导致果穗没有籽粒。病瘤初呈银白色，有光泽，内部白色，肉质多汁，迅速膨大，常冲破苞叶外露，表面变暗，略带淡紫红色，内部变灰至黑色，失水后外膜破裂，散出大量黑粉，即病菌的冬孢子。果穗发病可部分或全部变成较大肿瘤，叶上发病则形成密集成串小瘤。
