马铃薯晚疫病是真菌侵染，中高温，高湿度条件容易流行。防治晚疫病可使用霜霉威、霜脲氰、烯酰吗啉、氟菌·霜霉威、氟噻唑吡乙酮等药剂。在晚疫病发生初期，要及时清除病株，并进行第一次喷药，以后根据具体情况，7-10天喷药一次，一连喷2次。药剂可选择58％甲霜灵锰锌、64％杀毒矾、代森锰锌（大生M-45）、72％克露或69％安克锰锌等。为防止病菌产生抗药性，最好不同类型药剂交替使用。
重点抓好早疫病、晚疫病、环腐病及黑茎病、蚜虫以及窄缘施夜蛾等主要病虫害的防控工作。早疫病发病初期，可选用苯醚甲环唑、丙环唑、嘧菌酯（阿米西达）、百菌清、恶霜灵ž锰锌（杀毒矾）、氢氧化铜（可杀得）等药剂800～1000倍液连续喷施2～3次，每隔7d～10天喷一次。预防晚疫病、环腐病及黑茎病，可在齐苗后用150～200克丙烯基双二硫代氨基甲酸锌等保护性药剂兑水50公斤喷雾预防。
查明发病原因，有针对性的进行防治，如如果是植株抗性的问题，要加大有机肥施用。此种病害应该提前搞好土壤杀菌及时治疗效果最好。选用抗病品种，加强田间管理，实施预防为先，推广绿色防控。