番木瓜根腐病主要为害根颈及根部，育苗期和刚定植不久的小苗较容易感病。苗地及栽培地块过于潮湿或排水不良造成积水，土壤粘性大更易感染此病。植株发病初在茎基部呈水渍状，后变褐腐烂，叶片枯萎，植株枯死，根变褐坏死。对疫霉菌及腐霉菌引起的根腐病可选用的药剂有25%甲霜灵可湿性粉剂500~600倍液、72.2%普力克水剂500~800倍液和80%乙磷铝可湿性粉剂400倍液等；对于镰孢菌引起的根腐病可选用的药剂有70%恶霉灵可湿性粉剂、70%敌克松可湿性粉剂、50%多菌灵可湿性粉剂等。按产品使用说明施于植株根部土壤中，每隔7~10天1次，连施2~3次。
