病菌随病残组织在土壤中、或侵入薯块随贮藏越冬。病菌可在土中离体腐生14个月至6年。播种病薯可直接引起植株发病。在田间经灌水或雨水传播，从茎基部或根部伤口侵染，并可透过导管进入相邻的薄壁细胞。病菌侵入维管束后迅速繁殖、系统扩展、堵塞导管，阻断水分输导而致植株萎蔫。病菌喜高温高湿条件。10～40℃间均可发育，以30～37℃为最适。土壤低洼、含水量高、排水不良、阴雨连绵，或天晴后气温剧升时，发病严重。偏酸性土壤发病较重。线虫等地下害虫多的地块病害严重。马铃薯枯萎病属于典型的土传性病害，病部产生的分生孢子借雨水或灌溉水传播，从伤口侵入。田间湿度大、土壤温度高于28℃或重茬地、低洼地发病严重。
