发病原因与当地的环境条件有一定关系。病原菌以菌丝或分生孢子附着在病残组织内越冬，成为翌年初侵染源，借气流传播进行再侵染。当温度20～25℃、相对湿度90%以上时有利于病害发展。气温高于25℃或低于15℃，相对湿度小于60%，持续几天，病害的发展就受到抑制。在玉米种植区，从拔节到出穗期间，如气温适宜，又遇连续阴雨天，病害会发展迅速，极易大流行。玉米柄锈菌喜温暖潮湿的环境，发病温度范围15-35℃，最适发病环境温度为20-30℃，相对湿度95%以上。夏孢子在侵入时需高湿，叶面结露，适宜于夏孢子形成和侵入。
