影响发病的因素主要是温湿度条件、品种的抗病性和菌源量。幼苗发病直接与种子带病有关，带病率高则发病重。大豆连作或与前一年大豆地相邻，菌源量大，病害发生也重。灰斑病菌孢子萌发温度是基础，湿度是关键，孢子萌发最低温度为12℃，以21—26℃为最适，超过35℃萌发率明显降低。萌发的最低湿度为65%—75%，湿度越大萌发率越高。黑龙江省大豆灰斑病发病初期是7月初，8月下旬至9月初达到高峰，如果7月上旬到8月中旬雨量大，雨天多，相对湿度大，发病就重。
一般早熟大豆品种发病早而重。高温会抑制大豆灰斑病病情发展，高湿则加速病情蔓延。气温15～30℃，有水滴或露水存在，适于病菌侵入。气温25～28℃，持续有2小时结露，病害易流行。大豆重迎茬和不耕翻的地块，发病重。同时大豆种植密度过大，田间杂草多，植株郁蔽，通风透光差，或低洼易涝地块，发病均较重。大豆灰斑病菌丝生长最适温度为21～25℃，黑暗条件下有利于生长。分生孢子萌发的适宜温度范围为12～28℃，最适温度为24～26℃。只有在高湿条件下，分生孢子才能萌发侵染。气温15℃潜育期16天、20℃13天、25℃8天、28～30℃7天。分生孢子2天后侵染力下降26%，6天后失去生活力。生产上病害的流行与品种抗病性关系密切，如品种抗性不高，又有大量初侵染菌源，重茬或邻作、前作为大豆，前一季大豆发病普遍，花后降雨多，湿气滞留或夜间结露持续时间长很易大发生。